• Türkçe
    • English
  • English 
    • Türkçe
    • English
  • Login
View Item 
  •   DSpace Home
  • Enstitüler / Institutes
  • Fen Bilimleri Enstitüsü / Science Institute
  • View Item
  •   DSpace Home
  • Enstitüler / Institutes
  • Fen Bilimleri Enstitüsü / Science Institute
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Assocıatıng mıcrorna wıth ıts chemotherapy resıstance

Thumbnail
View/Open
10119709.pdf (1.065Mb)
Date
2016
Author
İğdeli, Muratcan
Metadata
Show full item record
Abstract
Genes are regulated by several factors including tiny molecules, called microRNAs. This regulation affects several processes in the cell. Recent findings suggest that microRNAs play important role in resistance to certain chemotherapies. The knowledge of what microRNAs are potentially resistant to given chemotherapies is therefore a crucial knowledge on drug design and therapy scheduling activities. In this thesis, we attempt to predict the list of microRNAs which are resistant to given drug using solely their mature sequence information. With this objective, we employ three common approaches for sequence classification in bioinformatics, i.e. pairwise, generative and discriminative models. The experimental results on a knowledge-driven dataset promote the use of pairwise models as a complementary tool in association studies for microRNAs and drugs. Genler mikroRNA olarak adlandırılan küçük moleküller gibi birçok faktör tarafından düzenlenir. Bu düzenleme hücrelerde birçok süreci etkiler. Güncel buluşlar mikroRNA’ların kemoterapiye karşı dirençte önemli bir rol oynadığını göstermektedir. mikroRNA’ların verilen kemoterapiye karşı potansiyel dirençleri hakkındaki bilgi ilaç dizaynı ve terapi ayarlanması üzerinde çok önemli bir bilgidir. Bu tez çalışmasında, verilen ilaca karşı direnç gösteren mikroRNA’ların listesi, yalnızca mikroRNA’ların olgun dizilerinin bilgileri kullanılarak tahmin edilmeye çalışılmıştır. Bu açıdan, 3 farklı ve biyo-enformatik alanında yaygın olarak kullanılan dizi sınıflandırma metotları kullanılmıştır. Bunlar ikili karşılaştırma yöntemi, yayımlayıcı yöntem ve ayırt edici yöntemdir. Bilgi odaklı bir dataset üzerinden elde edilen deneysel sonuçlar ikili karşılaştırma modelini, mikroRNA’lar ve ilaçları ilişkilendirmede tamamlayıcı bir araç olarak göstermiştir.
URI
http://hdl.handle.net/11727/2718
Collections
  • Fen Bilimleri Enstitüsü / Science Institute [300]

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback
Theme by 
Atmire NV
 

 

Politika
Açık Bilim Politikası
Kullanıcı Rehberi
Başkent Üniversitesi Kütüphanesi
Başkent Üniversitesi


sherpa/romeo

Browse

All of DSpaceCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsTypeLanguageCategoryThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsTypeLanguageCategory

My Account

LoginRegister

Statistics

View Usage Statistics

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback
Theme by 
Atmire NV